Первым местом дислокации Центра был поселок Марциена Мадонского района Латвийской ССР. Основой формирования Центра стали 10-й исследовательский отдел и учебные подразделения Центра боевого применения и переучивания летного состава (ЦБП и ПЛС) фронтовой авиации, 6-й исследовательский отдел и учебные подразделения ЦБП и ПЛС армейской авиации.

При формировании в подчинение Центру были переданы 14-й и 275-й отдельные исследовательско-инструкторские эскадрильи беспилотных самолетов разведчиков.

С 1994 по 2009 гг. местом дислокации Центра был г.Егорьевск в Московской области.

В 2009 г. Центр был передислоцирован в г. Коломну Московской области. В настоящее время в состав Центра входят управление центра, исследовательский отдел (применения и войсковых испытаний беспилотной авиации), курсы переподготовки и повышения квалификации (специалистов беспилотной авиации), две эскадрильи БЛА (исследовательско-инструкторская и средней дальности).

Со дня формирования личный состав Центра участвовал более чем в 200 учениях различного уровня. Наиболее крупными учениями, в которых Центр принимал участие в последние годы, являются совместное учение «Боевое содружество-2011», совместное оперативное учение «Щит Союза-2011», стратегические учения «Центр-2011», «Кавказ-2012», «Барьер-2013», «Запад-2013».

В настоящее время в Центре проходят обучение около 180 военнослужащих для комплектования формируемых рот БЛА Западного и Центрального военных округов.

Программа обучения включает три этапа: теоретическую подготовку, подготовку на учебно-тренировочном комплексе и выполнение практических полетов.

По завершении обучения военнослужащие сдают комплексный экзамен и получают соответствующие свидетельства. Всего до конца 2013 года планируется обучить до 800 военнослужащих формируемых рот БЛА всех военных округов.

Параллельно Центр занимается завершением войсковых испытаний комплексов с БЛА («Застава», «Наводчик-2», «Форпост», «Орлан-10» и др.), которые по окончании испытаний передаются на комплектование рот БЛА, говорится в сообщении Управления пресс-службы и информации Министерства обороны Российской Федерации.